东京FC与上海绿地申花的历史交战记录主要集中在2017年至2019年的亚冠联赛中。在2017年，双方共进行了两次交手，均在上海进行。2017年3月22日，上海绿地申花主场迎战东京FC，最终比分为2-1，比赛中，申花采用了4-4-2阵型，由瓜林和莫雷诺搭档双前锋，中场方面由秦升和曹赟定坐镇，后防线上金洋洋、柏佳骏等人表现出色，门将曾诚发挥稳健。东京FC则以4-3-3阵型出战，进攻端由奥利维拉和伊涅斯塔领衔。2017年10月18日，东京FC前往上海虹口足球场挑战上海绿地申花，最终比分为1-2，此役东京FC依旧采取了4-3-3阵型，但申花凭借瓜林和朱建荣的进球赢得了胜利。

2018年，双方再次在亚冠联赛中相遇，这一次是在东京进行。2018年4月17日，东京FC主场迎战上海绿地申花，最终比分为3-1，东京FC采用了4-3-3阵型，进攻端由莱昂德罗和小林悠表现突出，而申花则以4-4-2阵型出战，由瓜林和莫雷诺担任双前锋。2018年10月16日，上海绿地申花客场挑战东京FC，最终比分为1-2，申花方面由瓜林打入唯一一球，东京FC则由莱昂德罗和伊涅斯塔分别攻入一球。

2019年，双方在亚冠联赛中第三次交手，此次比赛同样在上海举行。2019年4月17日，上海绿地申花主场迎战东京FC，最终比分为2-2，申花方面由瓜林和杨旭各进一球，东京FC则由莱昂德罗和伊涅斯塔联手为球队扳平比分。2019年10月15日，东京FC再次来到上海，双方激战90分钟，最终比分为1-1，申花由瓜林打进一球，东京FC则由伊涅斯塔扳平比分。两队在比赛中都采用了4-3-3阵型，申花方面，瓜林和莫雷诺继续担任双前锋，中场由秦升和曹赟定坐镇；东京FC则由莱昂德罗和伊涅斯塔担任进攻核心。